- Maardu
- Maaritsa
- Maarja
- Mäeltküla
- Mäetaguse
- Maidla
- Maidla Parish
- Mäksa Parish
- Malda
- Mällikvere
- Mammaste
- Manija
- Männamaa
- Männikuste
- Maramaa
- Märjamaa
- Martna
- Massiaru
- Masti
- Matapera
- Meegomäe
- Meeksi Parish
- Meeri
- Mehikoorma
- Meleski
- Melliste
- Meremäe
- Metsaääre
- Metsakivi
- Metsaküla
- Metsalaane
- Metsapoole
- Metsküla
- Metsküla
- Metste
- Miiduranna
- Mikitamäe
- Misso
- Mõdriku
- Moe
- Mõhküla
- Mõisaküla
- Mõisamaa
- Mõisanurme
- Möldre
- Mõniste
- Mõnnaste
- Moora
- Mooste
- Munalaskme
- Muraka
- Muraste
- Mustivere
- Mustjala
- Mustla
- Mustvee
- Muuga
- Muuga
- Müüsleri
